Es parte de la Selva Lacandona, considerada el "centro de más alta diversidad biológica de América Septentrional". Fue creada el 13 de enero de 1978 y tiene 331,200 hectáreas, compartidas por los municipios de Ocosingo y Las Margaritas, al este del estado de Chiapas.

Su flora está formada por unas 4,300 especies, aproximadamente, presentando siete tipos de vegetación: selva perennifolia (la más extensa en México), selva suberennifolia, sabanas, bosque mesófilo de montaña, selva de galería, jimbales y bosque de pino-encino.

En esta área se han descubierto nuevas especies de las familias Eritroxilácea, Simarubacea y el suborden Lacandonia schismatica, que crecen junto a una considerable población de caoba (Swietenia macrophylla), cedro (Cedrela odorata), ceiba (Ceiba pentandra) y amate (Ficus Glabrata), árboles que alcanzan hasta 60 metros de altitud.

La fauna de Montes Azules es bastante variada, en ella se han registrado guacamayas rojas (Ara macao), loros cabezas azules (Amazonia farinosa) y blancas (Pionus senilis), águilas harpía (Harpia harpyja), zopilotes rey (Sarcoramphus papa), tlacuachillos acuáticos (Chinorectes minimus), tlacuaches dorados (Caluromys derbianus), grisón (Galictis vittata), cocodrilos de pantano (Crocodylus moreletti) y de río (Crocodylus acutus) y la tortuga blanca (Dermatemys mawe).

Dentro de la reserva hay dos especies estelares de mamíferos: el armadillo Cabassous centralis y el murciélago depredador Vampirus suspectum, ambos son endémicos del neotrópico septentrional y solo pueden avistarse en este sector de la Selva Lacandona.

Aquí también han fijado su residencia una nutrida población de monos arañas (Ateles geoffroyi) y aulladores (Alouatta pigra), jabalís de labios blancos (Tayassu pecari) y tapires (Tapirus bairdii).

Para llegar a Montes Azules se debe tomar la carretera fronteriza norte, la misma que se inicia en el entronque Palenque-Chancala a San Javier. Después se sigue rumbo a Bonampak, al norte de la reserva.